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高新技术企业认定法定程序
(一)企业自我评价及申请
企业登录“高新技术企业认定管理工作网”，对照本办法第十条规定条件，进行自我评价。认为符合认定条件的，企业可向认定机构提出认定申请。
(二)提交下列申请材料
1. 高新技术企业认定申请书;
2. 企业营业执照副本、税务登记证(复印件);
3. 知识产权证书(独占许可合同)、生产批文，新产品或新技术证明(查新)材料、产品质量检验报告、省级以上科技计划立项证明，以及其他相关证明材料;
4. 企业职工人数、学历结构以及研发人员占企业职工的比例说明;
5. 经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度研究开发费用情况表(实际年限不足三年的按实际经营年限)，并附研究开发活动说明材料;
6. 经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度的财务报表(含资产负债表、损益表、现金流量表，实际年限不足三年的按实际经营年限)以及技术性收入的情况表。
(三)合规性审查
认定机构应建立高新技术企业认定评审专家库;依据企业的申请材料，抽取专家库内专家对申报企业进行审查，提出认定意见。
(四)认定、公示与备案
认定机构对企业进行认定。经认定的高新技术企业在“高新技术企业认定管理工作网”上公示15个工作日，没有异议的，报送领导小组办公室备案，在“高新技术企业认定管理工作网”上公告认定结果，并向企业颁发统一印制的“高新技术企业证书”。
企业认定为高新技术企业后要做哪些工作?
高新技术企业是创新型国家的重要组成部分。高新技术企业认定是一个动态过程，反映的是引导企业做什么，怎么做?三年一复审，六年一重新认定。因此，企业认定为高新技术企业后，既要享受高新技术企业的优惠政策，又要履行高新技术企业在投入和创新方面应当履行的义务。为了保证三年后复审合格，六年后重新认定过关，企业必须做好以下工作：
(一)到地方税务机关备案，申请享受企业所得税减按l5%执行的缴税优惠：到地方科技局备案、申请享受地方科技资源的支持和地方科技局的指导。
(二)稳定投入研发费。巧妇难为无米之炊，企业要持续创新，持续发展，必须有持续的投入。而且，研发费投入比例是高新技术企业认定和复审的重要条件，是一票否决指标，因此，每年初，企业都要按销售收入计划，按规定比例，制定研发费投入预算，确定企业研发项目，包括新产品开发项目，确定专利等知识产权产生的预期数量和质量，有的放矢，有计划地开展研发活动。
(三)积极获取专利等知识产权。企业专利等知识产权的数量和质量是企业认定和复审高新技术企业的重要指标，也是一票否决指标，同时，也是检验研发费投入效果，检验企业创新能力的重要指标。企业从研发投入上保证了科技人员的创造，必须对科技人员的创造目标提出专利申请的要求，把创新和改进及时变为企业的知识产权，这是企业发展的需要，也是确保企业科技人员承担职务发明产生的智慧成果权属于企业的需要。因此，给经费、给项目、同时要制订专利申请目标，建设主动积极获取专利等知识产权的制度。
(四)积极进行成果鉴定。科技成果鉴定是当前专家们谈论最多的话题，实行市场评价，行业协会等中介机构鉴定是一发展方向，但目前申报国家科技计划项目，各级政府科技进步奖励，高新技术企业认定转化成果指标，申领许可证等，都要求提供政府科技部门组织的鉴定意见书。按照国家税务总局印发的“企业研究开发费用税前扣除管理办法(试行)”(国税发[2008]116号)第十三条规定，当主管税务机关对企业研究开发项目有异议的，可要求企业提供政府科技部门的鉴定意见书，因此，科技成果鉴定对企业而言也是一项十分重要的工作。因此，年初企业在给科技人员下达项目研究的同时，就必须提出成果鉴定的要求。给经费，要新产品、要成果，也要知识产权。顺便提醒一下，必须先申请知识产权，再发表论文，后进行成果鉴定，要严格遵守这一程序，否则失去新颖性不能申请知识产权。
(五)按年进行专项鉴证。企业的财务报表、技术研发费的投入，高新技术产品的收入通过有资质的中介机构鉴证是高新技术企业认定和复审的重要条件。企业技术研发费的加计扣除是当年进行的。因此，每个会计年度结束后，企业都应请有资质的会计师事务所和税务师事务所对企业的财务报表、技术研发费投入、高新技术产品收入进行归集鉴证，按照归集后出具的技术研发费投入鉴证报告，加计扣除技术研发费，使专项鉴证发挥的效益最大化，同时，对照高新技术企业的认定条件，及时进行修正有关指标。
(六)建立健全企业知识产权管理制度。用制度规范企业员工的行为，同时也为企业依法维护权益创造前提条件，企业必须建立健全知识产权管理制度，包括知识产权管理办法、专利管理办法、商标管理办法、专有技术管理办法、商业秘密管理办法、著作权管理办法、计算机软件管理办法：科技成果奖励办法等。为方便企业制定这些制度，我们把双流县知识产权局牵头制定的《企业知识产权创造管理制度》范本作为附录三列于后，仅供参考。
高新技术企业认定常见问题解答
办理高新技术企业认定需要在高新技术企业认定管理工作网上进行网上填报，本文就在进行高新认定网上填报时遇到的一些问题作了解答：
一、企业提交高新技术企业申报材料时，附件无法上传怎么办?
企业上传的附件材料的大小应该限制在5M以内，如超过则无法上传。
二、企业在提交高新认定申报信息时，为何保存不了?
企业按保存时，信息栏框如显示红色的，就说明该信息没填写正确，就保存不了。
三、提交高新技术企业认定注册信息后，为何一直显示正在处理中?
提交注册信息后，注册信息就发送到地方认定机构，地方认定机构要对该注册信息进行激活。可致电至联系地方认定机构查询。
四、打印高新认定申报书时，为何出现表格跨页或空白?
因每个表格是限定字数，其包括文字及空白的地方，文字不要分成几段，尽量减少空白格及空白行，不要超出限定字数，就可解决。
五、打印高新认定申报书时，为何有些栏目是空白的?
企业把文字直接粘贴进来时，把文档中的特殊字符粘贴过来，导致打印时不显示出来。企业应把文档文字复制到记事本中，再点击系统中空白框上方的按钮“粘贴为无格式文本”，就可解决。
六、提交高新技术企业注册信息后，为何一直显示正在处理中?
提交注册信息后，注册信息就发送到地方认定机构，地方认定机构要对该注册信息进行激活。
七、原系统企业找回密码时，提示“企业信息不存在”?
可与地方认定机构联系，核对之前填报的法人代码和税务登记号是否错误，重新登录后将其修改为正确值。
八、企业进行高新认定注册，系统提示“该企业信息已存在”，如何处理?
说明企业曾经注册过，请直接登录，或者如为原系统用户则直接通过【密码找回】重置用户名和密码。
九、进行密码找回时，接收不到系统发送的链接邮件，如何处理?
可与地方认定机构确认联系人邮箱或修改邮箱。
十、企业用户高新技术企业申报丢失系统注册号如何查找?
可与地方认定机构联系查找。
十一、密码找回时，为什么发到邮箱的链接会提示失效?
进行密码找回时，系统提示进入邮箱进行激活后30分钟内使用系统发回的链接。如超过30分钟，该链接会自动失效。
十二、企业密码忘记怎么办?
企业用户点击首页右上角【企业申报】，再点击【密码找回】，输入相关信息，就可重置密码。
十三、2010.1.31前已注册过(在原高新认定系统中)的企业用户如何获得用户名和密码?
在原系统申报的企业用户只有一个注册号(22位)，无用户名和密码，需重新设置用户名和密码。企业点击首页右上角【企业申报】，再点击【密码找回】，输入注册号、法人代码、税务登记号，注意法人代码要和原来填报时保持一致，输入后按提交，系统会发一个链接到联系人的邮箱，在30分钟内进入邮箱使用该链接，设置用户名和密码。
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