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办理高新认证的程序
自我评价—— 网上注册 —— 资料整理 —— 网上申报 —— 纸质材料上报 —— 认证部门评审 —— 公示 —— 科技部备案 —— 认证通知 ——发证
高新技术企业认定管理机构主要工作
各省、自治区、直辖市、计划单列市科技行政管理部门同本级财政、税务部门组成本地区高新技术企业认定管理机构(以下称“认定机构”)，主要负责本行政区域内的高新技术企业认定工作;接受企业提出的高新技术企业资格复审;负责对已认定企业进行监督检查，受理、核实并处理有关举报;选择参与高新技术企业认定工作的专家并报领导小组办公室备案。
对高新技术企业税收优惠政策的三个模糊认识
对“企业总收入”口径该如何掌握?劳务派遣人员是否计入企业从业人数?企业在取得高新技术企业资格后，按规定提交资料履行税收优惠备案手续，是否就应享受高新技术企业低税率优惠政策?对这三个问题，税企还存在不同认识。
由于高新技术企业资格认定涉及税务、科技、财政等多个职能部门，各职能部门对相关概念的理解和把握存在一定的差距，这既有税法本身不够完善的原因，也有对税法精神理解不到位的因素。
对收入总额计算口径的认识
企业所得税法实施条例第九十三条规定，国家需要重点扶持的高新技术企业，其需要满足的条件之一就是“高新技术产品(服务)收入占企业总收入的比例不低于规定比例”。在实际操作过程中，对本条件中的“企业总收入”口径如何掌握，各地莫衷一是，税企争议较大。
笔者认为，企业所得税法第五条出现了企业“收入总额”概念，且对收入总额进行了具体解释。企业所得税法实施条例有关高新技术企业条件之一当中出现的“企业总收入”概念，企业所得税法实施条例、《高新技术企业认定管理办法》和《高新技术企业认定管理工作指引》均未对“总收入”概念进行特别解释。笔者认为，从企业所得税法的角度看，“收入总额”的内涵是确定的，不存在任何歧义。“收入总额”和“企业总收入”是同一个概念，其内涵应当是一致的。“企业总收入”应按企业所得税法第六条规定的“收入总额”来理解。
对职工总数计算口径的认识
企业所得税法实施条例第九十三条规定，国家需要重点扶持的高新技术企业，科技人员占企业职工总数的比例不低于规定比例。对于科技人员和研发人员的统计，《高新技术企业认定管理工作指引》已有明确规定。但是有关职工总数的统计口径，尚无具体的税收规定。
从税收实践看，企业职工总数如果仅统计签订劳动合同人员而不包括在企业实际上岗工作的劳务派遣人员，容易导致企业在职工总数的计算方面作相应的筹划。
《财政部、国家税务总局关于执行企业所得税优惠政策若干问题的通知》(财税〔2009〕69号)对小型微利企业税收优惠当中的从业人数计算作了严格规定，即企业从业人数是指与企业建立劳动关系的职工人数和企业接受的劳务派遣用工人数之和。这个从业人数的概念与企业职工总数的概念应该是一致的。从企业所得税的角度看，虽然劳务派遣人员未与用工企业签订劳动合同，但劳务派遣人员在用工企业上岗，且接受用工企业的日常管理，用工企业也实际负担了这些人员的劳动报酬对价。因此，笔者认为，将劳务派遣人员纳入用工企业从业人数管理较为合理。
对取得高新技术企业资格的企业税收优惠落实问题的认识
税收实践中，有人认为企业在取得高新技术企业资格后，不论企业申报当年是否符合高新技术企业条件，只要企业按规定提交资料履行税收优惠备案手续后，就应享受高新技术企业低税率优惠政策。
笔者认为，企业要享受高新技术企业低税率优惠，前提就是要符合高新技术企业规定的条件。考虑到企业是否符合企业所得税法及其实施条例规定的条件，目前是由省级以上科技、财政和税务主管部门通过联合认定方式确定，企业提交认定的资料是企业实际申请享受优惠的以前年度资料，因此，企业是否继续符合高新技术企业条件，需要按照企业所得税法实施条例第九十三条及《高新技术企业认定管理办法》等规定，计算申请享受优惠的当年各项条件是否继续达标。如果当年各项指标达标，则当年可以享受高新技术企业优惠，否则，当年不得享受高新技术企业优惠。
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